有机肥的科学使用要遵循以下方法：
    一、注意选择优质有机肥：优质的有机肥是蔬菜优质高产的基础，而现在菜农施用的有机肥，大都是买来的商品有机肥，质量普遍较差，有些甚至掺杂了城市污泥、生活垃圾等，根本就达不到有机质含量的标准。即使是一些买来的鸡粪，也有不少掺杂泥土，或被一些不法商贩掺入火碱(用于增加体积)，这些劣质有机肥施入土壤后，效果可想而知。因此，生产中一定要选用优质的有机肥，选用商品有机肥时最好选用正规大厂生产的。
    二、严格控制施肥量：一般情况下，每亩菜地以施入纯鸡粪15～20立方米、稻壳粪35～40立方米为宜。茄果类蔬菜需肥量较大，可取其上限;叶菜类需肥量稍小一些，可取其下限。
    三、配合生物肥施用效果好：有机肥无论基施和冲施，最好配合生物肥施用。因为有机肥在与生物肥配合施用后，生物肥中的生物菌能加速有机肥中有机质的分解，使其更有利于作物吸收，同时能将有机肥中的一些有害物质分解转化，避免其对蔬菜造成伤害。